Doctor en Musicología por la Universidad de California, Los Ángeles (1991), director del Instituto de Música de la Universidad Alberto Hurtado de Santiago y profesor titular del Instituto de Historia de la Pontificia Universidad Católica de Chile. Estudia la música popular del siglo XX en Chile y América Latina, realizando contribuciones en los ámbitos histórico-social, socioestético y analítico. También realiza estudios de música docta del siglo XX en Chile, considerando la relación entre vanguardias y lenguajes locales.

Junto a sus abundantes monografías publicadas en revistas científicas internacionales y a sus permanentes colaboraciones en Artes y Letras de El Mercurio, Juan Pablo González es coautor de dos volúmenes de Historia social de la música popular en Chile (2005, 2009) junto con Claudio Rolle; Cantus firmus: Mito y narrativa de la música chilena de arte del siglo XX (2011) junto con Rafael Díaz; y autor de Pensar la música desde América Latina. Problemas e interrogantes, publicado en Santiago y Buenos Aires (2013).

En 2010 recibió la Medalla Bicentenario otorgada por el Consejo Chileno de la Música, organismo afiliado al Consejo Internacional de la Música, UNESCO, por su destacada labor en el ámbito de la investigación musicológica nacional.